Bir hastalık olmadığı sürece, akvaryum suyunun tamamını değiştirmeyin. Çünkü su sıcaklığındaki ve kimyasındaki ani değişim balıkların hasta olmasına ya da ölmesine neden olabilir. Öyle ki; bir gün içindeki pH değişiminin 0.3’ten, sıcaklıktaki değişimin 2-3 santigrat dereceden fazla olmamasında fayda vardır.
Su değişimi dip süpürgesi ile yapılır. Bu sayede hem akvaryumun dibine çökmüş ve filtrenin toplayamadığı artıklar temizlenmiş, hem de su değişimi yapılmış olur. Haftada bir defa suyun %20-25’ini değiştirmek genellikle yeterlidir. Ancak kalabalık akvaryumlarda daha sık su değişimi yapmak gerekebilir. Çünkü biyolojik kirlilik daha fazla olacaktır.
Su değişimi ile artan nitrat konsantrasyonu da azaltılmış olur. Bitkilerin olmadığı akvaryumda nitratı azaltmanın başka bir yolu yoktur. Nitrat belli bir konsantrasyonun üzerinde aynı amonyak ve nitrit gibi balıkları zehirlemeye başlar. Bunun olmaması için haftalık su değişimlerine gerek vardır.